细胞STR分型
细胞STR分型/细胞系STR检测/小鼠细胞系STR分型/猴细胞STR分型

      在过去的45年里，虽然科研工作者使用各种各样的传统方法来鉴定细胞，但细胞交叉污染的问题却有增无减。据估计，国外15-25%的研究论文因为使用了被错误辨识和交叉污染的细胞而导致错误的结论。这造成数以百万美元的研究经费的浪费，并产生了大量的无效数据。而在国内，这一比率将会更大。
      2007年NIH针对这一情况发布了通知，强烈建议在使用培养细胞的时候进行鉴定（authentication）。2008年底，专家提议ATCC致力于人源细胞系的鉴定工作，并制定鉴定的标准程序。近年来，大量研究表明STR基因分型方法是进行细胞交叉污染和性质鉴定的最有效和准确的方法之一。ATCC细胞库STR分型数据库中提供了各细胞株的数据供比对。

细胞STR鉴定的优势及应用：

      高度丰富信息，同时分析超过多个STR基因座，可以准确判断细胞交叉污染和细胞类型。
      高灵敏度，可以检测最低至0.1ng DNA（约15个二倍体基因组），微量污染也可检测。
      ATCC细胞库或其他细胞库若有有相应细胞STR分型数据，可与之比对得出所检细胞系的名称。
科研成果能够得到重复确认，对于证实科学发现是十分重要的。如果数据无法重复，那么这个结果能否得到业界的认可并为研究人员所追随就是个很大的疑问了。很多生物医药的研究都采用培养细胞来进行，这些细胞可能是从各大细胞库得来，也可能是受赠于其它研究人员。据估计，15-20%的时间里，实验中所使用的细胞已经不是原来的细胞系，或者与其它细胞系发生了交叉污染(1-3)。ATCC以及其它细胞库（Coriell Institute for Medical Research, European Collection of Cell Cultures (ECACC), Deutsche Sammlung von Mikrorganismen and Zellkulturen (DSMZ), Japanese Collection of Research Resources）都收到过提交的“错误”的细胞系，尽管提交者把细胞系提交到上述机构之前，还经过了检验。然而，最终证实这些细胞系还是鉴别错了。此外，干细胞也可能被污染，作为干细胞赖以增殖的哺育细胞层，小鼠细胞很容易污染到干细胞中。显然，细胞系遭到污染、特征鉴别错误，将会极大地威胁着基于这些细胞而发表的论文的质量和研究发现的正确性。因此，可根据细胞系的STR分型结果，对细胞的株系进行确认并对细胞的生长状态（是否存在交叉污染）进行监测。

细胞STR鉴定　　

背景介绍：
应用于生物医学研究领域的哺乳动物细胞被错误鉴定和交叉污染的问题，一直是一个普遍存在的突出问题。据统计，国外实验室有20%左右的细胞株被错误鉴定和交叉污染，NIH和ATCC近两年都对此发出呼吁，要求研究者对细胞进行鉴定。近年来，大量研究表明STR基因分型方法是进行细胞交叉污染和性质鉴定的最有效和准确的方法之一，STR基因分型应用于细胞鉴定已被ATCC等机构强烈推荐。阅微基因作为ATCC标准委员会成员，在国内率先推出了细胞STR鉴定服务并与多家研究机构、细胞中心、生产厂商等建立长期合作关系。

• 高度丰富信息：同时分析多个STR基因座，可以准确的判断交叉污染和细胞类型。
• 高度灵敏：可以检测最低0.1ng DNA（约15个二倍体基因组），微量样本即可满足需求，并且可以检测到早期污染。
• 高通量和系统化平台：采用自动化分析系统可大量检测及数据分析，结果更加准确、客观。

服务项目：
１．人类细胞16个基因座检测：
    所选用的基因座跟ATCC和JCRB细胞库中的基因座完全一致，可方便与权威数据库进行比对。位点如下：

2.人类细胞20个基因座检测：
    是目前基因座最多的检测服务，兼容以上各组数据之外更添加4个高度多态性位点——D19S433、D6S1043、D12S391和D2S1338，具有更高的准确性。

3．小鼠细胞检测
    分析小鼠基因组中8个高度多态性位：D1Mit159.1、D2Mit395.1、D4Mit170.1、D7Mit40、D11Mit4、D15Mit16、D17Mit51.1和Jarid1。

４．人鼠细胞交叉污染检测
国内首创技术，采用人鼠复合扩增体系检测人类细胞中的小鼠细胞污染，主要应用在干细胞研究领域。同时可以用于判断人鼠细胞混淆的情况。

送样要求：
细胞悬液（细胞数≥106 个）或基因组DNA（≥20μl，浓度≥50ng/μl）。

提供结果：
STR分型的图谱和检测结果的书面报告。

成功案例：
某三甲医院委托一株细胞鉴定是否存在交叉污染现象，本公司采用16个基因座系统检测（图1）。

图1　一株细胞的STR鉴定图谱
结果显示：该细胞在D13S317、D16S539、TH01和D8S1179共4个基因座出现三等位基因现象，说明有其他人类细胞交叉污染。